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荧光滤波片选取的原则是在成像端尽可能让荧光/发射光透过，同时完全阻挡激发光，获得最高的信噪比。尤其是对于多光子激发和全内反射显微镜的应用，微弱的噪声也会对成像效果造成很大的干扰，因此对信噪比的要求更高。
通常我们看滤光片的参数一般会看透射率光谱，但往往荧光相对于激发光的强度很弱，选择滤光片更需要参考阻挡深度光谱图——OD值。OD值更能直观地反映滤光片对光的阻挡特性。
在选择激发滤光片和发射滤光片时，两者的阻挡深度光谱交点（OD交点）是重要的判断标准，一般要求宽场光源激发是交点OD值大于5，激光激发时大于OD6，以实现较好的荧光信噪比。
